多重PCR和序列捕获芯片用于二代测序目标区域富集有什么差异?


@屈武斌 达人在回答 生物信息还需要云计算提供什么样的功能?时提到:设计高通量的多重PCR引物用于二代测序目标区域富集的话,特别是在100重以上,1000重以上的目标片段富集,那么多重PCR和序列捕获芯片用于二代测序目标区域富集有什么差异?包括其成本、速度和准确度上。
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赞同来自: BioStar 许岳楷 秤砣爸爸 Thomas007


感谢@BioStar 的邀请,不过由于我的知识所限,没有实力回答这个问题,附上一篇综述,请国际上的专家做回答。另外一篇文章是今年的文章,使用多重PCR富集制作文库,然后测序。目标区域是KRAS和EGFR的核心突变外显子。其实目标区域可以自由定制,或者说可定制性非常强。

不同目标区域富集方法的比较,图片来源于附件文献。

不过,上面的综述是2011年的,有些内容可能并不符合现在的情况。一个突出的例子是:这两年,有一个趋势我感受深切,特别是今年,有多个公司在寻找多重PCR引物设计软件。这个趋势可能能说明某些问题。

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