肿瘤基因突变检测能否在半小时内完成?


明确的单个位点,手术室规范获取样本,实时进行提取检测,请问什么方法能够半小时内完成检测,或者各位达人指点一下你们认为最快的方法,大概时间多少?谢谢!
已邀请:

任何基因检测的核心技术都离不开PCR,而一般一次完整的PCR反应,其时间就已超过半小时了,所以如果再考虑样本处理等其它环节,想在半小时以内完成整个检测,以目前的技术条件而言过于理想。当然,如果发挥想象力,还是会有一些技术手段可以考虑的,只是都无法满足目前的产业要求。

而对于大多数检测手段而言,经过合理的技术整合,在最理想的条件下,一天之内拿到检测结果还是可以达到的,比如通过桌面式测序仪进行检测。

以上几位从不同角度回答了这个问题,基本已经比较全面了。既然被邀请就再多说两句。
iknife是目前最接近问题答案的解决方案,基于质谱技术,直接检测小分子;核酸传感器和传统探针PCR都是针对核酸,实验步骤繁琐,化学反应本身限制了时间,很难达到一小时内。
因此“抛开本质看表象”的检测手段是压缩时间的研发方向,但另一方面灵敏性和特异性是需要考虑平衡的地方。

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理论上可行,我知道有个叫iknife的技术挺有意思的,可以一边做手术一边做组织的代谢鉴定,判断是否手术中的组织是肿瘤组织。这个可以号称可以实时进行肿瘤样本检测啊。

An "intelligent" knife that can sniff out tumours to improve cancer surgery has been developed by scientists

http://www.bbc.com/news/health-23348661
http://www3.imperial.ac.uk/new ... 17-32
http://www.webmd.com/cancer/ne ... erous

赞同来自: 唐小米 秤砣爸爸 yuyuan021


肯定可以做得到。

技术路径可以是这样子的:

  1. Bedside 2 Benchside 让临床组织变成实验材料,后者需要是biomarker载体,在本例中,需要是含有目标变异的DNA/RNA/肽段。这个过程目前已经有基于微流控的原型产品可以实现,对临床组织进行崩解和分类导出。

  2. Test 检出biomarker。这个应该使用单分子技术,避免建库过程,避免PCR。这个原型产品也存在,纳米孔测序嘛。如果只是检测固定的位点,实现上还要简单,可以在生物芯片技术上进行修改。

  3. Wetlab 2 Drylab 让实验结果报告出来。这是个生物信息分析过程,加速不算太难。


难处在哪里呢,难处在于把这几节技术串起来,形成临床可用易用稳定的Standalone的产品。概念验证都能做。

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.理论上是可行的。
2012年中科院广州生物医药与健康研究院研发出一种可检测出癌症相关基因突变的试纸。在家中,只要用一张小小的试纸便可知道自己是否带有癌症突变基因。用一张小小的试纸,滴两滴血即可知道待检人是否带有遗传病相关基因、耐药性突变或肿瘤突变基因。
这种试纸的“学名”叫核酸检测生物传感器,是中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组研发完成的。“取两滴血,经过核酸提取后,与检测试剂室温反应半小时,再滴到试纸上5分钟后就可观察到结果,如果有单核苷酸多态性引起的遗传病、肿瘤疾病的易感基因存在或病原微生物,检测就会显现出来,没有则不显示。”曾令文介绍说,例如胰腺癌中的K—ras基因突变。
曾令文表示,这项研究并不是简单地使用一个原理,而是运用多个原理整合而成。利用了四大技术:发夹结构探针技术、核酸信号转移放大技术、纳米晶金粒的可视化技术和试纸条简单、快速、方便的技术优点的结合,开发出该核酸生物传感器。
从目前该领域进展情况看,研究尚属于探索阶段,至于能否应用临床还有大量的工作要做。核酸提取装置研发有两种途径。一种是利用别人开发的核酸提取装置直接和核酸传感器结合起来,组成一个走向家庭的产品。另一种是我们自己正在研发的核酸提取装置,这个装置研发出来之后与核酸生物传感器进行结合。”

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都是高手,很棒的回答。

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半个小时肯定可以,但是价格肯定很贵,如果所有老百姓能接受的话,3~5天肯定是便宜又好,时间也能接受

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就目前的现成的技术来讲,没有。

不过好多回答都将思路限制于“PCR”,事实上从三代开始已经有些测序技术摆脱了PCR实现单分子测序。当然,应用这种测序技术,DNA提取、建库也不止半小时。

不过在体外运用微流控技术和biomarker传感器,或直接开发用于体内的核酸序列生物传感器,便有可能直接将序列信息转换为可肉眼读取的信号。难点在于,你所说的“肿瘤基因突变”究竟是有限个具体的已经预期的突变呢(比如单纯地检查BRCA是否存在易感突变位点),还是基因组水平的没有任何预期的突变的集合呢?如果是后者,肯定是没办法开发传感器的。

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光是提取DNA最快也得1小时,还不包括检测。
肿瘤基因突变检测如果基于提取,检测,pcr,结果分析这几步来的话,最快1天可以搞定。

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哈哈,我觉得半小时这个要求太苛刻了。和医院现在检测的结果3-5天给出结果,我觉得就可以接受了。

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现在有iCubate技术平台做分子诊断,以后可能是个方向。

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应该没问题。
丹麦的某医院好像36个小时之内

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应该可以的,用一张小小的试纸,滴两滴血即可知道待检人是否带有遗传病相关基因、耐药性突变或肿瘤突变基因。这种试纸的“学名”叫核酸检测生物传感器,是中科院广州生物医药与健康研究院曾令文研究组研发完成的。

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如果真能这么快,那真是太好了

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当然可以的。技术的发展非常快。

我能说其实现在也差不多了么?

提DNA,某些试剂已经可以在十几分钟内搞定。

定量PCR,快速模式的仪器和试剂盒已经完全可以在半小时内跑40个循环,那么如果设20个循环为阈值的话,也就是15分钟可以初步判定结果。

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但是,对于肿瘤样本的活检来说,考虑到样本的破碎,消化,看起来还是有些难度。

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