怎么看待华大基因刚披露的测序仪Revolocity?

已邀请:
最佳回复

赞同来自: MyGene unionx xjp13 simagang


华大基因官网的文章,我看不如@秤砣爸爸 摘录的呢:

CG的老大Cliff Reid接受了GenomeWeb的采访,我摘录一点信息如下:
一年10000个全基因组或者30000个外显子,最终会升级到一年30000个全基因组; 报价是1200万美元一台,占地面积1500平方英尺;
每8天完成120个50X的全基因组测序,可以分批上样,比如今天上20个,后天上10个之类的。最少一次上10个样品;
insert的长度是300base,两端的读长分别是28base——bwa mem都不能用了; 暂时不支持CG的LFR技术;
暂时不考虑申请FDA的clearence; 已经在全球找到了200~300个值得放这套系统的地方;
确实在开发桌面测序仪,但拒绝透露具体信息。

赞同来自: simagang


期待有更多的参数公布~~~

赞同来自:


Revolocity™测序系统基本信息(来源:GenomeWeb):
  • 每年可完成10000个人全基因组的测序和分析工作,最终会升级到每年30000个人全基因组;
  • 报价为1200万美元一台,占地面积1500平方英尺(约140平方米);
  • 采用全自动化样本处理系统,每套样本处理系统每年可以处理30000个样本,样本可以是基因组DNA、血液、或唾液;
  • 一个人的全基因组测序从样本处理、测序到数据分析一共需要8天;一个循环可以测定120个人的样本(全基因组测序),允许分批上样,如今天上40个样本,2天后上另外40个样本,但每次最少上10个样本;
  • Insert的长度是300 base,双末端测序,读长分别是28 base;
  • 通过该系统测定的人全基因组的覆盖度可达96%,错误率约为10的负6次方;
  • 该系统推出后先用于全外显子组和全基因组测序,后续可能会开发其他应用,如RNA-seq等;
  • 侧重于临床应用。

赞同来自:


大基因子公司Complete Genomics的Revolocity测序系统首次亮相
发布日期: 2015-06-06
澳大利亚健康服务公司Mater和荷兰奈梅亨大学医学中心签下首批“超级测序仪”

美国加州山景城,2015年6月6日–华大基因全资子公司、人类全基因组测序的创新领导者Complete Genomics今天宣布,澳大利亚健康服务公司Mater和荷兰奈梅亨大学医学中心成为Revolocity™测序系统的首批用户。Revolocity™是Complete Genomics公司新推出的一款完全集成式的“超级测序仪”,并于今天在欧洲人类遗传学会议上首次推介。

近年来,基因测序和计算技术飞速发展,通量大大提升,基因组测序成本大幅下降。Complete Genomics一直引领着行业的发展,已完成超过20,000个人类全基因组测序并积极推动新一代测序技术(NGS)在临床研究的应用。Revolocity™系统结合了Complete Genomics新一代测序技术和操作经验,是首个真正集成式的大容量测序系统,可以满足实验室对拥有一个前沿的基因组中心的需求。

Revolocity™测序系统一年可完成10,000个全基因组测序,并将增加到每年30,000个——超越所有现有的测序方案。该系统也支持全外显子组测序。它可以对人全血、唾液等各种样本进行自动化的DNA提取,并将样本进行文库制备、测序和数据分析的无缝连接操作。该系统可以交付高准确度的小变异数据,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入,缺失、替换、拷贝数变异(CNVs)和结构变异。

位于澳大利亚布里斯班的Mater健康服务公司,将把Revolocity™系统投放到其2016年中落成的核心实验室,成为澳大利亚首家基于基因组学的临床诊断服务提供商。Mater病理学主任Deon Venter教授表示,很荣幸将最前沿的全基因组测序技术用于改善澳大利亚乃至欧亚患者的诊疗效果。急性和预防性医疗对这个技术的需求很庞大,这将是未来几十年医疗领域最大的进步。与常规的基因检测相比,全基因组测序的诊断率得到大大提高,还可以提供药物筛选等重要的额外信息。心脏病、神经和发育疾病、新生儿以及癌症患者将受益于此项技术。

奈梅亨大学医疗中心转化基因组学教授Joris Veltman表示,对于像我们这样开展临床研究的学术中心来说,获得从血液样本到注释基因组这一套完整解决方案非常重要。Complete Genomics提供的解决方案可以极大地促进复杂基因组检测的开展。过去,我们与Complete Genomics已经建立了良好的合作关系,其基因组测序技术给我们留下了深刻的印象。我们很高兴能将这项技术进一步延展用于大规模外显子组和基因组测序。

Complete Genomics首席执行官Clifford A. Reid博士表示,Mater和奈梅亨大学医疗中心是公认的澳大利亚和欧洲改善疾病诊疗、推动个性化医疗的领导者。我很高兴他们都选择了Revolocity™系统作为核心平台。Revolocity™系统的高通量和自动化功能将这两个机构的基因组和外显子组测序能力提高到前所未有的水平,实现一系列新的检测项目的开发。

更多Revolocity™信息,请访问:http://www.completegenomics.com

Complete Genomics

位于美国加利福尼亚山景城,是人类全基因组测序的创新领导者。通过其领先的测序设备和软件,已经完成了超过20000个人类基因组测序。Complete的愿景是通过向研究者和临床医生提供核心技术和商业系统,以改善人类健康,更好地了解疾病的预防、诊断和治疗。如需了解更多信息,请访问:http://www.completegenomics.com

Mater健康服务公司

Mater下属多家医院、健康中心、一所世界级医学研究院、病理和药房业务,目标是提供额外的健康护理。如需了解更多信息,请访问:www.mater.org.au

奈梅亨大学医疗中心

奈梅亨大学医疗中心是一所领先的学术中心,涵盖病患护理、教育和研究,愿景是“给医疗带来重大的影响”。我们的行动有助于改善医疗以及个人和社会的健康。我们相信,通过提供优质、参与性和个性化医疗、精益运作和协作,我们可以实现这一目标。如需了解更多信息,请访问:www.radboudumc.nl/EN

要回复问题请先登录注册