怎样找到现有的所有乳腺癌乳腺癌易感基因的数据?


还有如果想分析各个基因对于乳腺癌的危险程度,该怎么分析?
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既然问的是乳腺癌的易感基因,那应该想找的不是像BRAC1,2上面的变异了,当然它们的变异可以去clinvar或HGMD上找,还有几个Brac1,2专有的数据库,我记不清地址了。私有的数据库,应该首推myriad的,不过应该你看不到,这是别人吃饭的家伙。
然后说易感位点。通过GWAS技术,前人已经找到很多跟乳腺癌相关的SNP位点了,你可以去gwas catalog里面看看,搜breast cancer,association有375个,可以导出表格,当然后面还要手工过滤一下,里面会有一些无关信息。要嫌不够,去pubmed上找文献吧,优先找meta-analysis的文献。各个位点对于乳腺癌的危险程度,看OR值,大部分的位点研究者还都会给OR的。初步分析就看这些了,当然要深入研究,还要考虑样本量,人种,meta-analysis等问题,不知道你的研究目的,很难在这里细说了。

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